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Workshop: Fundamental principles of next-generation sequencing

Red Refama Cursos y talleres

Workshop Date: October 14th

Workshop Title: Fundamental principles of next-generation sequencing.

Workshop Schedule

8:00am to 11:30am

  • Workshop Introduction
  • Performing a de novo versus a template assembly
  • Mapping reads from an RNA-seq project

12:00pm to 2:00pm – Lunch

2:00pm to 5:00pm

  • Generating and analyzing a SNP Report
  • Annotating a transcriptome using Blast2GO
  • The fundamentals of DNA and protein sequence analysis

Tentative Workshop Components

  • A Guide to Free Resources: for performing and analyzing next-generation sequencing datasets.
  • Introduction
  • Applications and Uses: of next-generation sequencing technology. For example a) RNA-sequencing, b) phylogenetic studies, c) GWAS.
  • Scientific talk: An example of the use of next-generation sequencing as illustrated with a published research paper (Gross et al., 2013)
  • Glossary: terms to know for NGS studies.

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Fecha del Taller: 14 de Octubre 2016

Título del Taller: Principios fundamentals de la Secuenciación de Próxima Generación (NGS).

Horario

8:00am a 11:30am

  • Introduction
  • Realización de un ensamble de novo en versus ensable con un templado
  • Mapeo de Lecturas de RNA-seq

12:00pm a 2:00pm – Comida

2:00pm a 5:00pm

  • Generating and analyzing a SNP Report
  • Annotating a transcriptome using Blast2GO
  • The fundamentals of DNA and protein sequence analysis

Componentes del Taller

Una Guía para programas de acceso gratuito: para el análisis de datos

Introducción

  • Usos y Aplicaciones: Tecnología de secuenciación de próxima generación. Por ejemplo: a) RNA-seq, b) Estudios Filogenéticos, c) GWAS.
  • Seminario Científico: Caso de estudio utilizando secuenciación de próxima generación utilizada (Gross et al., 2013)
  • Glosario: Términos.